第三世代的寶可夢在《寶可夢朱/紫》有了些許改動：雨天隊的大將大嘴鷗不再會清除迷霧；詛咒娃娃學會了劍舞；在固拉多和蓋歐卡十分強力的情況下，裂空座一直沒有在對戰中有好的表現，本作學會了急速折返和隱形岩；其餘改動請到頁面內查看詳情。

寶可夢朱紫第三世代習得技能變化

大嘴鷗失去了除霧

鬥笠菇獲得了近戰和垃圾射擊

鐵掌力士獲得了吸取拳和突飛猛撲

勾魂眼獲得了億萬吸收

恰雷姆獲得了下壓踢和起草

噗噗豬獲得了詭計、魔法閃耀、大地之力

吞食獸獲得了大快朵頤、劍舞、毒棱

貓鼬斬獲得了腹鼓、高速移動

詛咒娃娃獲得了劍舞

熱帶龍獲得了暴風和急速折返

裂空座獲得了急速折返和隱形岩

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